{"id":1118,"date":"2015-06-24T15:17:00","date_gmt":"2015-06-24T15:17:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.euroresidentes.com\/tecnologia\/nanotecnologia\/ensamblan-el-primer-genoma-completo-de"},"modified":"2016-03-04T10:47:54","modified_gmt":"2016-03-04T10:47:54","slug":"ensamblan-el-primer-genoma-completo-de","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.euroresidentes.com\/tecnologia\/nanotecnologia\/ensamblan-el-primer-genoma-completo-de\/","title":{"rendered":"Ensamblan el primer genoma completo de un organismo vivo utilizando un dispositivo del tama\u00f1o de un tel\u00e9fono m\u00f3vil"},"content":{"rendered":"<div class=\"separator\" style=\"clear: both; text-align: center;\">\n<a href=\"http:\/\/4.bp.blogspot.com\/-fLV3Cnnbs7A\/VYrJC0soGJI\/AAAAAAAAB6k\/0E6sRHy5IxE\/s1600\/GENOMA.png\" imageanchor=\"1\" style=\"margin-left: 1em; margin-right: 1em;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" border=\"0\" height=\"240\" src=\"https:\/\/www.euroresidentes.com\/tecnologia\/nanotecnologia\/wp-content\/uploads\/sites\/6\/2015\/06\/GENOMA.png\" width=\"320\" \/><\/a><\/div>\n<p>Investigadores de Canad\u00e1 y el Reino Unido han secuenciado y ensamblado, por primera vez, el genoma completo de un organismo vivo, la bacteria <i>Escherichia coli<\/i>, utilizando un <b>dispositivo MinIONTM de Oxford Nanopore, un secuenciador de genoma que cabe en la palma de una mano<\/b>. <\/p>\n<p>Seg\u00fan el Dr. Jared Simpson, investigador principal del Instituto de Ontario<br \/>\npara la Investigaci\u00f3n del C\u00e1ncer y autor principal del estudio, <b>los resultados<\/b>, publicados recientemente en la revista <i>Nature Methods<\/i>, <b>demuestran que la tecnolog\u00eda funciona y sientan las bases para usarla para secuenciar los genomas de organismos cada vez m\u00e1s complejos<\/b>, hasta llegar finalmente a los seres humanos. <\/p>\n<p>Lo m\u00e1s sorprendente del nuevo dispositivo es:<\/p>\n<ul>\n<li>Su tama\u00f1o: es muchas veces m\u00e1s peque\u00f1o que un secuenciador normal<\/li>\n<p><\/p>\n<li>Y que basta con conectarlo a un ordenador port\u00e1til a trav\u00e9s de un cable USB<\/li>\n<\/ul>\n<p>\u00abNuestro trabajo es una demostraci\u00f3n de las capacidades de la tecnolog\u00eda, pero el avance m\u00e1s significativo est\u00e1 en los m\u00e9todos. Pudimos modelar matem\u00e1ticamente la secuencia de nanoporos y desarrollar maneras de reconstruir genomas completos con este peque\u00f1o secuenciador\u201d, se\u00f1al\u00f3 Simpson. <\/p>\n<p><b>Un inconveniente de la tecnolog\u00eda es que las lecturas que produce son, realmente, mucho menos precisas que las producidas por dispositivos de mayor tama\u00f1o<\/b>. Se necesitan herramientas bioinform\u00e1ticas m\u00e1s potentes para corregir los errores. Sin embargo, los m\u00e9todos desarrollados por Simpson y sus colegas son capaces de superar la tasa de error y calcular una secuencia final m\u00e1s precisa. <\/p>\n<p>Seg\u00fan el Dr.Nicholas Loman, coautor principal del art\u00edculo e investigador independiente del Instituto de Microbiolog\u00eda e Infecci\u00f3n de la Universidad de Birmingham, este ha sido un fant\u00e1stico ejemplo de colaboraci\u00f3n exitosa en la investigaci\u00f3n a larga distancia entre Canad\u00e1 y el Reino Unido. <\/p>\n<p>\u201cHemos explorado nuevas formas de trabajo, entre las que tendr\u00e1 lugar un <i>hackat\u00f3n <\/i>para explorar el desarrollo de nuevos algoritmos y utilizando los recursos inform\u00e1ticos compartidos en la Infraestructura en la Nube de Bioinform\u00e1tica Microbiana financiada por Consejo de Investigaci\u00f3n M\u00e9dica y con sede en Gales y Midlands, en el Reino Unido\u201d.<\/p>\n<p><b>El m\u00e9todo de ensamblaje ideado por los autores sigui\u00f3 tres etapas:<\/b><\/p>\n<ol>\n<li>Se detectan y corrigen las superposiciones entre las lecturas de la secuencia mediante un proceso de alineaci\u00f3n m\u00faltiple<\/li>\n<p><\/p>\n<li>Se ensamblan las lecturas correctas con un ensamblador Celera<\/li>\n<p><\/p>\n<li>Se refina el ensamblaje utilizando un modelo probabil\u00edstico de las se\u00f1ales el\u00e9ctricas producidas por el ADN al moverse a trav\u00e9s de los nanoporos<\/li>\n<\/ol>\n<p>\n\u201cEste trabajo tiene un potencial incre\u00edble\u00bb, se\u00f1al\u00f3 el Dr. Tom Hudson, presidente y director cient\u00edfico del Instituto de Investigaci\u00f3n del C\u00e1ncer de Ontario.\u201cAmpliada, esta tecnolog\u00eda se podr\u00eda utilizar, alg\u00fan d\u00eda, para secuenciar genomas tumorales. La naturaleza port\u00e1til del dispositivo permitir\u00eda que la secuenciaci\u00f3n fuese algo mucho en mucho m\u00e1s accesible, proporcionando un diagn\u00f3stico y un tratamiento m\u00e1s personalizados a m\u00e1s pacientes\u201d.<\/p>\n<p>Fuente: <a href=\"http:\/\/www.nanotech-now.com\/news.cgi?story_id=51685\">http:\/\/www.nanotech-now.com\/news.cgi?story_id=51685<\/a><\/p>\n<p>&nbsp; <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Investigadores de Canad\u00e1 y el Reino Unido han secuenciado y ensamblado, por primera vez, el genoma completo de un organismo vivo, la bacteria Escherichia coli, utilizando un dispositivo MinIONTM de Oxford Nanopore, un secuenciador de genoma que cabe en la palma de una mano. 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